In qualità di fondazione di diritto pubblico, il Fondo di garanzia è un’istanza ufficiale ed ha la competenza di emanare atti dispositivi. L’organo superiore è il Consiglio di fondazione, in cui trovano posto le organizzazioni centrali dei partner sociali, l’amministrazione pubblica e un membro neutrale. L’autorità di vigilanza è la Commissione di alta vigilanza della previdenza professionale (CAV PP).
L’amministrazione è delegata all’Unione per la gestione del Fondo di garanzia, un'associazione delle più importanti organizzazioni della previdenza professionale. Il Fondo di garanzia è finanziato da tutti gli istituti di previdenza assoggettati alla Legge sul libero passaggio.
